Link e a Princesa Zelda vão juntos ao Festival Picori, que celebra a relação harmoniosa de humanos com seres pequeninos que os ajudam. Porém, na cerimônia de premiação do vencedor do torneio do festival, o misterioso Vaati petrifica a princesa e Link sai em busca da solução.
Em Phantom Hourglass, segunda história do volume, Link está viajando a bordo do navio da Capitã Tetra e eles se deparam com um navio fantasma. Link e Tetra vão investigá-lo e acabam sendo separados da tripulação. Algo terrível acontece com Tetra e Link se alia a Linebeck e Ciela para reverter a situação.
